Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms