Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00520-202ENST00000554196 514 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 Z94057.1-201ENST00000569593 847 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010761.1-201ENST00000582718 899 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011442.1-201ENST00000587831 366 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000711.1-201ENST00000624964 917 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012594.1-254ENST00000628002 438 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGEA9B-203ENST00000595065 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAMEF13-201ENST00000625019 1606 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAMEF30P-201ENST00000438176 1417 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2A-211ENST00000631185 1435 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 MBIP-201ENST00000318473 1586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAMEF17-201ENST00000376098 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 RFC4-201ENST00000296273 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 PPARG-201ENST00000287820 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 PIP-201ENST00000291009 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 OR4A5-201ENST00000319760 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 DBI-202ENST00000355857 637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP204-201ENST00000365481 310 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00676-201ENST00000416090 474 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 645 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00423-201ENST00000421002 903 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC098820.1-202ENST00000438978 750 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AL161646.2-201ENST00000450054 369 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 PCCA-AS1-202ENST00000451662 474 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL424P-201ENST00000468013 289 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 CC2D2A-205ENST00000503658 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023886.1-201ENST00000506057 685 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 HAVCR2-204ENST00000522593 975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms