Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms