Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDC6Q99741 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms