Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms