Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms