Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms