Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms