Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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