Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms