Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms