Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms