Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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