Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms