Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms