Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms