Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms