Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms