Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms