Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms