Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms