Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms