Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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