Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF827Q17R98 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms