Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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