Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CARTPTQ16568 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms