Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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