Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms