Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SSPNQ14714 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SSPNQ14714 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SSPNQ14714 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SSPNQ14714 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SSPNQ14714 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SSPNQ14714 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SSPNQ14714 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SSPNQ14714 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SSPNQ14714 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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