Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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