Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms