Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms