Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NAE1Q13564 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NAE1Q13564 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NAE1Q13564 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NAE1Q13564 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NAE1Q13564 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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