Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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