Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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