Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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