Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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