Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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