Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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TRAF1Q13077 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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TRAF1Q13077 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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TRAF1Q13077 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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TRAF1Q13077 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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TRAF1Q13077 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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