Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
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