Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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