Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms