Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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