Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 PROC-206ENST00000429925 581 ntTSL 313.39□□□□□ -0.271e-9■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 POR-210ENST00000439297 569 ntTSL 413.22□□□□□ -0.291e-9■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 POR-215ENST00000453773 498 ntTSL 412.63□□□□□ -0.391e-9■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PROC-207ENST00000431364 566 ntTSL 411.89□□□□□ -0.511e-9■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PROC-205ENST00000427769 598 ntTSL 411.66□□□□□ -0.541e-9■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PROC-210ENST00000474030 501 ntTSL 410.18□□□□□ -0.781e-9■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 POR-208ENST00000432753 561 ntTSL 49.78□□□□□ -0.841e-9■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 POR-220ENST00000475509 590 ntTSL 59.46□□□□□ -0.91e-9■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 POR-207ENST00000426184 565 ntTSL 49.41□□□□□ -0.91e-9■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 POR-204ENST00000414186 548 ntTSL 49.36□□□□□ -0.911e-9■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RRM2-208ENST00000487591 592 ntTSL 26.9□□□□□ -1.31e-9■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RRM2-205ENST00000462343 454 ntTSL 25.76□□□□□ -1.491e-9■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 UQCRC2-204ENST00000563711 2008 ntTSL 27.96□□□□□ -1.148e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 UQCRC2-209ENST00000567597 312 ntTSL 52.34□□□□□ -2.038e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.951e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.951e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 STK25-215ENST00000439101 779 ntTSL 523.66■■□□□ 1.384e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 FBXW5-202ENST00000428398 718 ntTSL 523.42■■□□□ 1.342e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 FBXW5-203ENST00000443788 839 ntTSL 223.25■■□□□ 1.312e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.064e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL37A-207ENST00000478153 2082 ntTSL 1 (best)21.5■■□□□ 1.034e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ENTPD6-205ENST00000417467 809 ntTSL 521.37■■□□□ 1.014e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.994e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL27-208ENST00000593262 1872 ntTSL 220.62■□□□□ 0.891e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CNOT3-203ENST00000440571 1125 ntTSL 520.58■□□□□ 0.892e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.834e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.824e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 STK25-214ENST00000436917 499 ntTSL 419.76■□□□□ 0.754e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 STK25-227ENST00000483603 572 ntTSL 519.76■□□□□ 0.754e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 STK25-219ENST00000452891 575 ntTSL 419.61■□□□□ 0.734e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.734e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.652e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HJURP-203ENST00000414924 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 419.02■□□□□ 0.644e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.624e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.614e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.534e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PRR5-210ENST00000459857 560 ntTSL 418.34■□□□□ 0.534e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-212ENST00000551749 2091 ntTSL 218.2■□□□□ 0.51e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-211ENST00000550973 1111 ntTSL 518.17■□□□□ 0.51e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.494e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.464e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.434e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CTNNBL1-205ENST00000447935 778 ntTSL 517.73■□□□□ 0.434e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.434e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.422e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.394e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 DEAF1-210ENST00000529717 705 ntTSL 517.38■□□□□ 0.372e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.354e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SRSF4-206ENST00000605204 1399 ntTSL 1 (best)17.06■□□□□ 0.324e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 YPEL3-208ENST00000566401 522 ntTSL 316.99■□□□□ 0.314e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-213ENST00000552347 1645 ntTSL 516.88■□□□□ 0.291e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 FBXW5-208ENST00000491246 785 ntTSL 516.8■□□□□ 0.282e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.262e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PRR5-213ENST00000492289 735 ntTSL 316.55■□□□□ 0.244e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CORO1C-210ENST00000549384 891 ntTSL 516.51■□□□□ 0.232e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CORO1C-219ENST00000552871 587 ntTSL 316.51■□□□□ 0.232e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.214e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.192e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 GOLGA4-204ENST00000429018 2036 ntTSL 1 (best)16.06■□□□□ 0.164e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 FTSJ3-206ENST00000580272 615 ntTSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.152e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL37A-201ENST00000359681 742 ntTSL 1 (best)15.96■□□□□ 0.154e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 JPT2-213ENST00000569256 911 ntTSL 1 (best)15.9■□□□□ 0.144e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CORO1C-214ENST00000550542 1245 ntTSL 515.87■□□□□ 0.132e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ENTPD6-206ENST00000418890 656 ntTSL 315.85■□□□□ 0.134e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RNF10-207ENST00000536869 644 ntTSL 515.76■□□□□ 0.114e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SRSF4-202ENST00000466448 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.67■□□□□ 0.14e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.042e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TRIM11-206ENST00000602582 682 ntTSL 315.23■□□□□ 0.034e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -04e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.014e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 YPEL3-211ENST00000568681 1739 ntTSL 214.93□□□□□ -0.024e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.054e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-201ENST00000084795 612 ntTSL 1 (best)14.67□□□□□ -0.061e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-207ENST00000549533 666 ntTSL 214.67□□□□□ -0.061e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.061e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.061e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.061e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.064e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-206ENST00000549370 628 ntTSL 514.62□□□□□ -0.071e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HJURP-208ENST00000453122 634 ntTSL 414.6□□□□□ -0.074e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ENTPD6-211ENST00000435520 878 ntTSL 314.57□□□□□ -0.084e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.084e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 JPT2-211ENST00000567717 857 ntTSL 314.54□□□□□ -0.084e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.094e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.134e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ENTPD6-208ENST00000427553 451 ntTSL 314.18□□□□□ -0.144e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 FTSJ3-202ENST00000577263 598 ntTSL 214.14□□□□□ -0.152e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 414.08□□□□□ -0.164e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-202ENST00000546623 541 ntTSL 513.98□□□□□ -0.171e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ASAP3-208ENST00000492982 3024 ntTSL 213.97□□□□□ -0.172e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.174e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 FTSJ3-207ENST00000580290 597 ntTSL 213.71□□□□□ -0.212e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 FTSJ3-210ENST00000581209 592 ntTSL 313.71□□□□□ -0.212e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CHRD-213ENST00000482014 560 ntTSL 413.7□□□□□ -0.222e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.224e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.222e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 DEAF1-202ENST00000524786 475 ntTSL 413.63□□□□□ -0.232e-7■■□□□ 11.7
Retrieved 100 of 27,864 protein–RNA pairs in 191.7 ms