Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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EFEMP1Q12805 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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EFEMP1Q12805 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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EFEMP1Q12805 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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