Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms