Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms