Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms