Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms