Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms